Centar za stočarstvo provodi svoje aktivnosti u skladu sa sljedećim zakonskim propisima:
- Zakon o Hrvatskoj agenciji za poljoprivredu i hranu (NN 111/2018)
- Zakon o poljoprivredi (NN 118/18, 42/20, 127/20, 52/21, 152/22)
- Zakon o uzgoju domaćih životinja (NN 115/18, 52/21)
- Zakon o veterinarstvu (NN 82/13, 148/13, 115/18, 52/21, 83/22, 152/22)
- Zakon o zdravlju životinja (NN 152/2022)
- Zakon o zaštiti životinja (NN 102/17, 32/19)
Centar za stočarstvo pruža pomoć poljoprivrednim proizvođačima pri popunjavanju Jedinstvenog zahtjeva za potporu na temelju Pravilnika o provedbi izravne potpore poljoprivredi i IAKS mjera ruralnog razvoja.
Centar aktivno sudjeluje u provedbi Nacionalnog programa očuvanja izvornih i ugroženih pasmina domaćih životinja u Republici Hrvatskoj 2021-2025.